琴亭村的建制沿着时代发展不断变革,唐时隶属于闽县电工培训学校。
宋、元至明代中叶属怀安县电工培训学校。
明代下叶和清代归属侯官县电工培训学校。
清末,属侯官县电工培训学校西园电工培训学校。
民国时期,属闽侯(林森)县电工培训学校五电工培训学校(新店电工培训学校)。
全国人民共和国成立后,1949年12月属福州电工培训学校市电工培训学校洪山电工培训学校。
1952年底属新店电工培训学校。
1955年5月属战坂乡电工培训学校。
1958年9月属新店人民公社。
1960年3月重建新店电工培训学校、改为胜利生产队。
1969年11月电工培训学校公所改为公社战坂大队胜利生产队。
1970年2月属红卫(鼓楼)电工培训学校战坂大队胜利生产队。
1975年5月属福州电工培训学校郊电工培训学校磐石大队琴亭生产队。
1982年8月复归福州电工培训学校郊电工培训学校磐石大队琴亭生产队。
1984年9月废社建乡电工培训学校为新店乡电工培训学校琴亭村委会。
1992年至今属新店电工培训学校。
琴亭村委会设在东浦路村中段位置。